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如何从GEO数据库下载数据
如何从GEO数据库下载数据TCGA及GEO数据库是生信分析的两大主要数据来源,其中GEO数据库提供大量的临床与实验数据。本文旨在介绍如何从GEO数据库下载数据,主要分为两个示例:基因表达数据集与...
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从geo数据库下载数据的几种方法
尔云间 一个专门做科研的团队原创 xiao'guo 生信果对于...今天小果将带大家学习如何从GEO数据库下载你所需要的数据,让GEO数据库成为你科研路上重要的助力。GEO数据库所包含的信息1)GEO Platform(G
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GEO芯片数据下载分析全攻略需要的赶紧过来!
课程先是按照不同数据的网页,为大家讲解了GEO数据库中Series页面数据下载、Sample页面数据下载以及Platforms页面数据下载。1.Series页面数据下载 在Series页面,我们的重点是看懂研究内容和...
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一分钟教你从GEO数据库中查找并下载数据
❣️言归正传,GEO数据库是常用到的数据库之一,那么如何在GEO中查找并下载想要的数据呢?希望这篇笔记能给你一些帮助[斜眼R] 如果你喜欢小叮当的笔记,就点赞关注哦[害羞R] 还想看小叮当分享...
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实用帖
一篇帖子教你如何上传GEO数据库,建议收藏,再也不用愁“书到用时方恨少”了。1、创建账号 如果要上传GEO数据库,首先要创建NCBI帐号,网址:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/submitter/
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从GEO数据库下载矩阵数据
后来有了RNA-seq,如果同时做多个样品的RNA-seq,表达量矩阵后来也可以上传到GEO数据库里面,只有看到文献里面有提到GEO数据库,都可以通过这个R包俩进行批量下载,其实就是网页版的一个API调用...
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从geo数据库下载数据的几种方法
今天小果将带大家学习如何从GEO数据库下载你所需要的数据,让GEO数据库成为你科研路上重要的助力。GEO数据库所包含的信息 1)GEO Platform(GPL)芯片平台 2)GEO Sample(GSM)样本ID号 3)GEO Series...
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芯片数据分析步骤1 芯片数据下载
从GEO数据库下载数据的方法 1、在GEO DATASETS中输入关键词,选择符合的GSE,在ftp中进行 手动下载 2、找到符合的GSE,在R中使用 GEOquery 包进行下载 GEO数据库的数据种类 1、Platforms 平台 ...
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GEO芯片数据下载分析全攻略需要的赶紧过来!
课程先是按照不同数据的网页,为大家讲解了GEO数据库中Series页面数据下载、Sample页面数据下载以及Platforms页面数据下载。1.Series页面数据下载 在Series页面,我们的重点是看懂研究内容和...
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