茶树中CsHSF

序列检索方法，即是基于本实验室测定的茶树‘安吉白茶’转录组和基因组数据，根据NCBI中热激转录因子序列在茶树转录组库中寻找同源性高的基因。找到HSF-A1和HSF-A8在转录组中的序列。其中NCBI数据库的检索方法即是，在检索框...

转录组分析

NCBI设立了专门的数据库dbEST来存放这些数据。1995年Velculescu建立了短标签来标识法SAGE测序方法，利用转录本3端第一个CATG位点下游14p长的短标签来标识相应的转录本。SAGE方法相比EST测序在...

转录组

数据下载1.GEO数据库简介NCBI Gene Expression Omnibus（GEO）是一个存储各种高通量实验数据的公共数据库。这些数据包括基于单通道和双通道微阵列的实验，检测mRNA，基因组DNA和蛋白质丰度，以及非阵列技术，如基因表达系...

请问我送测的转录组学在ncbi上选择的第一个参考基因组,拉丁名是一样的,但是比对率只有60%,这样可以用吗?还是建议选择无参?百泰派克生物科技

（2）可靠性较低：组装质量（如contig的完整性和准确性）可能不如基于参考的分析。（3）注释依赖公共数据库：对功能注释的依赖可能导致信息不够全面。四、建议优化策略1、尝试更好的参考基因组（...

ncbi站点的一般介绍

可用于生物医学研究、基因组学、转录组学等领域的数据分析和解释。通过NCBI站点，用户可以获取到各种类型的生物学数据，并使用...

NCBI论文文献

9. Prediction Model of Metabolic Syndrome防患于未然—代谢综合症发病趋势预测模型 张胜利；童泽坤；尹昊宇；丰一帆 摘要： 本文建立基于动态变异和随机转录的人类生命量化模型,对个人生物分子间相互作用和基因通路信息进行定理研究.据此筛选出代谢综合症的4个生理指标:中心肥胖指数、血压强度、血糖含量和血脂浓度.用Clinical-Trials.gov的临床数据求解模型得到,当推荐代谢综合...

ncbi

全基因组测序(WGS)分析 转录组分析RNA-seq的分析流程 染色质免疫共沉淀技术ATAC-Seq、ChIP-Seq分析 单细胞scRNA-seq分析 癌症的预后标志物查找 系统发育演化进化树构建与分析 群体遗传学分析 全基因组关联分析(GWAS) 基因家族的分析 甲基化测序与分析 KEGG/GO功能富集分析 图形绘制具体细节的比如热图、曼哈顿图的绘制等 python、perl、R的包的使用过程 具体工具的使用，比如GATK的使用过程

NCBI SRA数据库使用详解

GEO数据库是NCBI（美国国家生物技术信息中心）维护的一个大型公开数据库，它包含了全球范围内的基因表达数据，以及表观遗传、转录组、蛋白质组等多组学数据。这份教程旨在帮助用户有效地检索、下载和分析GEO数据库中.如何用N...

私人定制实验室数据库，打造您的专属NCBI

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