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生物信息学作业
进行分析: (1) 查找到该基因的GenBank accession number,相应的蛋白序列数据库accession number,下载该基因mRNA和蛋白的GenBank格式文件和FASTA文件。 (2) 利用BLAST和FASTA工具分别查找与该基因mRNA和氨基酸序列同源的基因(请针对nr和EST数据库比较)。 (3) 通过同源比较的方法确定该基因的染色体定位。该染色体位点有无重复出现的畸变,其类型是什么。 (4) 查找该基
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解释:the ncbi ncbi的
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基因同源性分析
利用NCBI BLASTP软件对中国对虾FcMKK4基因编码的 氨基酸 序列进行同源比对。发现该序列与肩突硬蜱(Ixodes Scapularis)的同源性最高,为80%。与其他无 脊椎动物 如印度跳蚁(Harpegnathossaltator)、大红斑蝶(Danaus plexippus)、佛罗里达弓背蚁(Camponotus floridanus)、意大利蜜蜂(Apismellifera)、切叶蚁(Acromyrmex echina
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速看!基因组查找及评估方法2.0来了
基因组查找 我们这里介绍几种基因组查找的方法。1.NCBI查找NCBI全名是美国国家生物信息中心,是一个数据库。在NCBI中搜索基因组比较简单,如图,物种...
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NCBI资源介绍及使用手册
Cn3D “See in 3-D”,一个用于NCBI数据库的结构和序列相似显示工具,它允许观察3-D结构和序列结构或结构结构同源比较。Cn3D用起来就象你浏览器上的一个帮助工具。VAST 矢量同源比较搜索工具...
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NCBI所有数据库简介
...基因表达数据)HomoloGeneHomoloGeneHomoloGene数据库是一个在20种完全测序的真核生物基因组中自动检索同源基因的系统,包括直系同源与旁系同源。HomoloGene的结果报告包括基因同源性和来...
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NCBI基因序列数据库使用和检索方法
NCBI[文献标识码】A[文章编号]1 008—0821(2O O 3)1 2 一 O 224—02 NCBI 基因序列 数据库(ht tp:/www... |文档星级:| 情 报 纵 横 2003 年 12 月 第 12 期 NCBI 基 因序列 数据库 使用和检 ...
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如何在NCBI上查找引物序列
在NCBI上搜索不同物种的同一基因,通过序列分析软件(比如DNAman)比对(Alignment),各基因相同的序列就是该基因的保守区。2.引物长度一般在15~30碱基之间。引物长度(primer l 201...
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从GenBank获取基因序列及PCR引物设计的方法
NCBI设计引物步骤浏览:41详细描述了使用NCBI中的BLAST Primer设计引物的步骤,仅供读者参考大数量基因序列PCR保守引物的设计浏览:22大数量序列是指在序列数据库中,超出程序一...
ncbi查找基因的同源物
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