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如何从NCBI下载基因组序列和注释文件并统计基因个数
从NCBI下载一个物种的基因组文件。假设我们要下载一个叫做Tetranychus urticae的物种,首先在NCBI上genome中搜索Tetranychus urticae。得到如下截图:然后复制genome和gff的下载地...
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NCBI序列提交方法
H七for mm NCBI account 在已登陆状态下点击 SubmitSubmit 点击图中标记处选择 GengBankGengBank实用标准 文案大全 点击 GOGO 选择:Banklt:Banklt:How to submit data to GenBank The owt ...
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根据cblaster结果文件获取序列和物种信息
_ncbi获得序列的表格信息从结果文件“abspres1.csv”提取blast_hit上下游10kb碱基序列:from Bio import Entrez, SeqIO import pandas ...
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NCBI上基因组文件格式及解释
最近在对于一些关于基因组的数据进行处理,发现如果在NCBI上下载一个物种例如E.coil的基因组序列之后,有很多并不常见的文件类型,例如.asn.faa.ffn.fna*.val 等等,处于好奇,特意去查了这些...
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NCBI序列比对方法与实例操作 图文.ppt
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NCBI数据库中,使用BLAST比对工具时,输入比对序列的文件格式为()
ComputepI/Mw计算的是()的分子量和等电点。A.成熟形式的蛋白质B.UniProtKB数据库中的蛋白质C.翻译后修饰的蛋白质D.输入的蛋白质序列点击查看答案 进入题库练习
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ncbi查找目的基因序列
可以看到大量的信息,如下图:二、用Probe查找已经公布的引物序列进入NCBI主页,在下拉菜单选择Probe之后填写需要查找的基因名称...
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一文走进NCBI数据库,科研事业轻松一大步
Version就像是序列的身份证号码一样。通过这个号码,可在NCBI等数据库里查到该序列的数据。GI number是由一系列的数字组成,是NC...
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关于RefSeq:NCBI参考序列
可以参考这个网站,列出了许多电子文件引用指南:http://www.ifla.org/I/training/citation/citing.htm。我如何访问RefSeq记录?RefSeq记录为下列分子类型和基因组提供:分子 登录格...
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国家基因库成GISAID中国首个授权机构,助病毒数据共享
在本次新型冠状病毒疫情中,该平台已经汇总了国家基因库归档及NCBI的病毒序列数据资源159条(截至3月13日),助力研究人员快速发现、检索和分析病毒。华大方面称,CNGBdb作为GISAID正式...
ncbi序列文件信息解读过程
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