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  • NCBI基本功能和引物设计

    这是理论分析措施中最关键旳一步。完毕这一工作必须使用多序列比较算法。常用旳程序包有BLAST、FASTA等序列同源性分析：是将待...

  • NCBI使用教程3基因序列的比对

    NCBI（美国国立生物技术信息中心）提供了一个强大的工具——BLAST（局部相似性基本查询工具），用于将DNA/蛋白质序列与公开数据库的所有序列进行匹配比对，从而找到相似序列。BLAST是由NCBI开发的一个基于序列相似性的数据库搜索程序。 生物序列的相似性是指一种直接的数量关系，比如部分相同或相似的百分比或其他一些合适的度量。比如说，A序列和B序列的相似性是80%，或者4/5。这是个量化的关系。当然可进行自身局部比较。

  • ncbi序列数据库概述(2017316).pptx

    NCBI序列数据库时间、NCBI概述1988年11月美国国家健康研究所(NIH)、国家医学图书馆(NLM)发起成立;1992年,NCBI建立GenBank核酸序列数据库,将美国专利商标局存储的专利序列并入GenBank管理并与EMBL、DDBJ实现数据...

  • clustalw序列比对

    ncbi.nlm.nih.gov/tools/cobalt/ 进入COBALT的界面如图1-A所示，跟Blast的界面是相似的，比较简单，也是用Fasta格式的序列，这里就不多讲了...

  • 如何利用BankIt向NCBI在线提交序列

    分析测试,百科网,如何利用BankIt向NCBI在线提交序列,关专题向NCBI提交序列常用的方法有两种，其一是在线提交的BankIt，其二是用软件Sequin。在此结合网络牛人实际操作经验来总结下如何通过BankIt在线提交DNA 或RNA序列...

  • 速来围观！——三种NCBI常见数据库

    refseq序列是NCBI筛选过的非冗余数据库，一般可信度比较高。NCBI作为生信分析最牛逼的网站，还包含有很多其他重要的数据库，后...

  • 如何向NCBI提交序列(在线提交法)Public Library of Bioinformatics

    1.整理序列信息：包括病原采集地、病原的寄主、寄主症状、采集人等基本信息；还有序列分析结果，包括序列全长大小，开放阅读框（ORF）的长度、位置及特定ORF序列翻译的氨基酸序列等基因水平的信息，这对于接下来的快速准确提交序列及提交成功后为全世界其他作者准确全面分享此类信息很重要；

  • NCBI上传序列的方法

    向NCBI提交序列常用的程序有两个,一个是在线提交的BankIt,一个是用软件Sequin。用那种办法,根据不同的需要。一.BankIt:(在线提交页面:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BankIt/index.html) 1.适合...

  • NCBI各数据库简介

    除了建有GenBank核酸序列数据库(该数据库的数据资源来⾃全球⼏⼤DNA数据库，其中包括⽇ 本DNA数据库DDBJ、欧洲分⼦⽣物学实验室数据库EMBL以及其它⼏个知名科研机构)之 外，NCBI还可以提供众多...

  • 【转帖】如何使用NCBI寻找所需基因的信息

    这就要查找文献了，参考影响因子比较高的文章里用的序列。我做的是原发性免疫缺陷病，文章introduction都会写明序列号的。希望有帮助。原帖由 dior ...

ncbi序列对比分析

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