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NCBI使用教程之三基因序列比对及BLAST应用
在本篇教程中,我们将介绍如何利用NCBI对基因序列进行比对以及如何使用BLAST这个强大的工具来寻找与目标序列相似的其他序列。接下来,我们来了解一下序列相似性比较的过程。Score表示序列比对...
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菌种16sRDNA测序,NCBI比对结果怎么分析?360问答
菌种16sRDNA测序,NCBI比对结果怎么分析?第一:打开Bioedit软件,导入拼接好的样品序列与标准亚型参考序列File New Alignment Sequence New Sequence 导入拼接好的样品序列和标准参考序列(从...
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NCBI使用教程之三基因序列比对及BLAST应用
在本篇教程中,我们将介绍如何利用NCBI对基因序列进行比对以及如何使用BLAST这个强大的工具来寻找与目标序列相似的其他序列。接下来,我们来了解一下序列相似性比较的过程。Score表示序列比对...
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如何使用NCBI进行blast比对
NCBI上的blast分为四种: Nucleotide BLAST :核酸比核酸; blastx :核酸比蛋白; blastn :蛋白比核酸; Protein BLAST :蛋白比蛋白。 在这里小编以Nucleotide BLAST的操作为例,演示一下如何进行
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如何在ncbi上比对序列
进入这个网址,把你所要比对的序列输入序列框中,在下面的选项中选择对应.怎样用 NCBI/blast 做蛋白质同源性分析 详细点 将需要比对的蛋白质序列选中,在BLAST界面EnterQuerySeque...
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NCBI基因序列数据库使用和检索方法.pdf
其中,比较著名的有美国国家生物技术信息中心(NationalCenterforBiotechnologyInformation)开发的genbank数据库、13本的DDBJ核酸序列数据库、欧洲的 EMBL核酸数据库,此外还有许多其...
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ncbi查找目的基因序列
与专攻基因组检索的Ensembl不同,NCBI数据库的内容更加庞杂和全面,它可提供36种数据检索与分析工具,这其中就包含大家都非常熟悉的文献数据库PubMed。而我们利用NCBI查找目标序列,主要是基于它的RefSeq、即参考序列数据库(ref...
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ncbi查找目的基因序列
自打1990年由Altschul SF等人开发出来,NCBI引进,至今还在改善,更新._怎么从转录组数据中blast目的基因
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NCBI的RNA序列
我想问一下为什么在NCBI上寻找的RNU6这个RNA的序列是含有T碱基的,RNA序列的碱基不是U嘛?RNA-seq在subread比对时提示不能找到gene identifie 同时输出的txt文件格式混乱 linux ...
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关于已知DNA序列在NCBI上比对并鉴定菌种
PAGE_TYPE=BlastSearch&PROG_DEF=blastn&BLAST_PROG_DEF=megaBlast&BLAST_SPEC=blast2seq)分析了你的序列,完全匹配的序列比例比较低。完全匹配区对应第一条...
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