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还在用Primer Premier 5? 来试试Primer Premier 6 吧
1 我们在NCBI上面找到目的基因序列,我们以p53为例,找到p53的mRNA的CDS序列。2...
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NCBIBLAST软件比对结果详细分析
NCBI BLAST比对结果报告分析:BLAST是NCBI开发的一款序列相似搜索程,常用在线的BLAST比对工具进行序列比对分析和引物设计。写在解读报告之前的,首先就使用Blast最终的目的是什么达成一致,Blast是通过两两比对,找到数据库...
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BioEdit及MEGA分析序列同源性简介
3.4 亚型的初步分析:3.4.1 用NCBI 基因分型工具进行亚型的初步分析。3.4.2 双击下面的网址/projects/genotyping/formpage.cgi3.4.3 在相应位置填入序列的FASTA/GI/Accession 格式文件。3.4.4 ...
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关于种属鉴定、NCBI的BLAST比对和DNAMAN同源性分析的问题
ncbi主页 进入 blast 进入 nucleotide blast 将序列粘入窗口中 选择nucleotide cllection(nr/nt)选项 进行比对就可以了 出来的序列相似性最高的就是你的目的序列 追问这一步我基...
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UCSC的使用方法(一)
然后再选择 Gene and Gene Predictions 里的 NCBI RefSeq 作为想要导出的本地数据库。在导出格式里,我们选择了比较...
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GEO数据挖掘流程+STRING VS R in KEGG/GO
从GEO上下载的表达谱的行名是probe_id探针名,但是不同的平台,探针名不同,我们也无法直观地知道某个样本在某个探针上的表达量是那个基因的表达量,于是就需要将探针名转换为大家公认的NCBI的...
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关于生物软件的使用问题
请问怎么我在NCBI上直接导出的fasta格式的数据不能直接导入clustalx呀。是我下载的数据有问题吗?直接用记事本打开fasta文件,复制序列部分,新建一个记事本文件: 第一行起序列的名字,后...
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GEO数据库简介
GEO可和其他NCBI数据库一样用标准关键词的方 法和基于文本布尔检索、基于序列检索、基于特有 表达行为挖掘检索或结合这些参数来进行检索查询 例如:在GEO DataSets中可以用检索词“prostate ...
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进化树的建立过程
1,通过测序后,在 NCBI 中进行 BLAST 比对,看和哪个属中的种最近,从而确定进化树 中需比较的菌种,然后可以在权威的 International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology ...
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常见蛋白质种类
其他相关链接 生物大分子数据库(NHGRI/NCBI Histone Sequence Database)2D与3D结构 预测数据库(SWISS-3DIMAGE-展示蛋白质和其他生物大分子的3D结构图形)PC机和工作站上有大量软件工具用于查看...
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