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2009年新型甲型H1N1流感病毒全基因组序列重组分析及同源性比对
方法从NCBI基因数据库下载2009年新型甲型H1N1流感病毒(A/H1N1)代表性全基因组序列,先用MEGA4.0软件对8个基因序列片段进行比对和拼接;然后将历史上流行的H1N1、H5N1、H3N2等不同宿主(人、禽、猪)的流感病毒全基因组序列用MEGA做比对拼接,并用NJ法构建进化树。采用Simplot 3.5.1软件分析2009年新型甲...
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必须收藏 | 这个网站很酷,一键了解基因的所有同源基因及进化关系
...氨基酸序列所有基因都提供链接,直接链接到NCBI数据库,还有更多功能均可以试试。网址:http://www.plant.osakafu-u.
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核酸序列的基本分析
碱基同源性分析 运用 NCBI 信息库的 BLAST 程序对基因进行碱基同源性分析(Translated query vs.protien database(blastx))网站如下:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/参数选择:Translated ...
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常用网站介绍|基因宝库之NCBI篇(一)
...提供该基因编码的蛋白名称。界面最后 NCBI Reference Sequences (RefSeqs) 和 Related Sequences 两个版块均可用于查找目的序列。Related Sequences中多为研究人员自己提交...
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Blast使用
Blast能够实现比较两段核酸或者蛋白序列之间的同源性的功能,它能够快速的找到两段序列之间的同源序列并对比对区域进行打分以确定同源性的高低。Blast的运行方式是先用目标序列建数据库(这种数据...
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人类基因组的序列图.ppt
NCBI、EBI和CIB相互合作,共同维护着GenBank、EMBL、DDBJ三大基因序列数据库。它们每天通过计算机网络互相交换数据,使得三个数据库能同时获得最新数据。此外,他们每年召开两个年会讨论合作...
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生物信息学毕业论文
3.1.2 同源序列获得 利用ncbi上的blast程序对比直接获取与绵羊mhc class基因同源的核酸和蛋白质序列。3.2 蛋白质的基本性质分析3.2.1 疏水性分析 用位于expasyde的protscale6(/cgi-bin/...
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北京高同源序列分型公司「上海翼和应用生物供应」
把几个相似的或相关的氨基酸或碱基的序列放到NCBI或者clustalw软件中进行对比,比对出其相似的程度。相似度越高,说明序列的同源性越高。上海翼和应用生物技术有限公司是上海市遗传学会理事单位...
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25个鸡品种DMB2基因序列比较分析
[方法]本研究对25个不同鸡种的DMB2基因序列进行目标捕获测序,以NCBI上Gallusgallus的DMB2基因序列作为参考序列,通过MEGA6软件进行序列比对分析,筛选出不同鸡种DMB2基因序列上的S...
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经验教程:Real
互联网上有公共BLAST服务器可供您使用(例如www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST)。BLAST程序会将一段查询序列与特定数据库中的所有序列进行对比。为了获得特异性的引物和探针,您应当仅使用与其他序列...
ncbi基因序列对比同源性
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