MEGA的使用

获得meg的文件1.获得序列（没有的可以找我）2.直接拉到mega的软件图标上，打开3.然后align4.根据自己的需要选择参数，这里我选择默认5.比对（可能会花很长时间）6.保存为meg文件在data里...

MEGA构建系统进化树的步骤|Public Library of Bioinformatics

进行对齐，对齐过程需要一段时间，对齐完成后，最好将序列两端切齐，选择两端不齐的部分，单击右键，选择delete即可。4. 关闭当...

如何使用MEGA软件构建系统发育树

无需更改，选择“OK”继续。出现对比进度条框，等待完成. 可见，对比完成后，序列碱...

序列相似性比较与同源性分析

用于确定该序列的生物属性，也就是找出与此序列相似的已知序列是什么，完成这一工作只需要用到两两序列比较算法，常用的程序包有BLAST，FASTA等。同源性分析是将待研究序列加入到一组与之...

MegaX进化树构建与分析方法介绍

做系统进化树之前要做多序列比对，将比对结果提交给MEG. 系统进化树的建立（完整）...

mega使用教程

在比对之前需先选中要进行比对的序列（Shift），还可以对序列或者序列名进行编辑（双击）。比对参数选择：保存比对文件，进化树分析提供数据。

【转】MEGA构建系统进化树的步骤(以MEGA7为例)

经过大量实际比对发现，如果令被比对的两个核苷酸相同时得分为+5 分，不相同为-4 分，这时比对效果最好。这个矩阵广泛地被 DNA 序列比较所采用。没有为什么，就是好，实践经验所得。因为这...

两条序列比对与多序列比对

1.3 设定序列比对位置 MegAlign 允许使用者选择序列的一部分进行比对分析，例如，可以根据 GenBank 格 式的序列中 Features 部分关于编码区（CDS）位置的描述，设定只对此编码区进行分析。a....

实验2 序列比对

MegAlign ClustalX 和 MUSCLE 进行两条序列和多条序列比对分析。实验内容： 双序列比对是使两条序列产生最高相似性得分的序列排列方式和空格插入方式。两条序 列比对是生物信息学最基础的研究...

构建系统进化树的方法步骤

此过程中生成的报告文件*.nj比较有用，里面列出了比对序列两两之间的相似度，以及转换和颠换分别各占多少。(7)TreeView File-Open-C:\temp\jc-a.njbphb Tree...