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基于GEO数据库分析水稻低温胁迫关键基因
为了筛选水稻在低温胁迫下的关键基因,从GEO数据库下载水稻4个数据集中的70个样本。利用在线分析程序GEO2R进行共同差异表达基因分析,并对这些差异表达基因进行GO、KEGG分析,构建蛋白质互作网络,对关键基因构建热图。结果表明...
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GEO数据库数据页面介绍(三)
GEO数据库数据页面介绍(三),视频播放量 1068、弹幕量 1、点赞数 10、投硬币枚数 4、收藏人数 17、转发人数 4,视频作者 生信交流平台,作者简介 分享生信技能,相关视频:GEO数据...
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基于GEO数据库食管癌关键基因和信号通路分析(英文)
目的 基于GEO数据库,通过分析癌症组织的高表达基因,筛选用于免疫治疗的抗原靶点,并通过富集分析、PPI网络和生存分析等方法,探讨癌症相关的关键通路和分子机制。方法 通过筛选高表达基因,借助于TMHMM和IEDB平台,分析蛋白质...
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GEO数据库之GPL文件学习
在 GEO数据库 使用过程中,GPL文件是接触最多的数据之一,那么GPL文件是什么,它又是什么样的?带以上的问题去学习GPL文件...
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GEO数据库外部验证
该回答引用GPTᴼᴾᴱᴺᴬᴵ 要将TCGA得到的风险模型公式应用到GEO数据库中,您需要进行以下步骤: 1.从TCGA数据集中获取Cox回归公式 您可以使用在TCGA数据集上使用Lasso回归筛选得...
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GEO芯片数据下载分析全攻略需要的赶紧过来!
课程先是按照不同数据的网页,为大家讲解了GEO数据库中Series页面数据下载、Sample页面数据下载以及Platforms页面数据下载。1.Series页面数据下载 在Series页面,我们的重点是看懂研究内容和...
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