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GEO数据分析之必备基础知识
如何让基因名称在多个数据库间随意转换?Limma求差异基因构建矩阵的两种方式GEO的样本名称太多而且排序不规则,你们都是手动分组的么?GEO芯片分析中的大坑,差异基因完全相反!GEO芯片如果超过了两组,也可以一次搞定差...
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GEO多套数据如何合并进行分析?(之二)
因为另一栏里的GEO数据我都挖好久了,所以还是看看TCGA,这里也只有二十多个测序数据可以挖.上期我们介绍了通过GEO2R分析GEO的数据(不懂R,怎么分析GEO的数据(1)?
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GEO数据挖掘
cn/m/view.php?aid=1683、GEO中多个芯片可否合并分析?http://www.dxy.cn/bbs/topic/415140184、多个GEO数据库芯片联合分析--batc._geo在线分析网站
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多个GEO数据库芯片联合分析
本课程讲解GEO数据库多个芯片联合分析-batch normalization,课程内容包括多芯片联合分析简介,GEO数据下载,平台文件有gene symbol的注释,平台文件有gene bank的注释,合并多芯片数据,批次矫正,差异表达,多legend热图绘制...
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R语言实现GEO多数据集的分析
大家对GEO的数据应该都很熟悉,那么如何把GEO中多个研究进行合并分析成为一个比较棘手的问题,今天给大家介绍这么一个包可以实现多研究的合并分析。首先我们看下前期需要的准备工作: 代码...
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多个GEO数据库芯片联合分析
产品名称:多个GEO数据库芯片联合分析--batch normalization 产品品牌:生信自学网 录制平台:win10系统(课程有效服务期2...
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GEO数据挖掘全流程分析
本例以GSE42872数据集为例,学习GEO数据挖掘分析,分析文献 通过阅读文献找到相应的GSE数据集,并在官网可以下相应的数据集信息及背景知识 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo...
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比GEO2R更好用的GEO数据分析工具
之前在介绍GEO数据库数据分析的时候,我们介绍过GEO2R这个在线的分析GEO芯片数据的工具。但是对于GEO里面的一些二代测序的数据,就没办法进行分析了。最近新发布了一个在线的数据库eVITTA,则...
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GEO数据库 如何选择某一数据集中的部分样本进行差异分析呢?360问答
一种常用的方法是使用 GEO2R 工具,它是 GEO 数据库的内置差异分析工具,可以让您在线对 GEO 数据进行差异分析。在使用 GEO2R 时,您可以在“Sample Information”页面中选择需要分析的样本。您可以选择多个样本作为组内样本和组间样本...
在线分析geo多个数据
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