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  • 单细胞RNA测序 vs.单细胞核RNA测序，如何选择？生物通

    在阅读文献时，我们经常会看到有些课题组使用了单细胞RNA测序（scRNA-seq），有些则使用了单细胞核RNA测序（snRNA-seq）。一字之差，似乎也暗藏玄机。尽管这两种技术的原理相似，但它们各有优势，因此适合不同的应用。本文讨论...

  • 单细胞RNA测序

    单细胞RNA测序文献解读、数据分析，主要针对10x Genomics数据文献解读 Potter, S.S.(2018).Single-cell RNA sequencing for the study of de. 文章首发于医信Medchat 11月文献解...

  • 单细胞RNA测序技术之入门指南

    若要评选出目前最受欢迎的一道菜，那恐怕非单细胞RNA测序莫属。以往，研究人员通常利用RNA测序（RNA-seq）来检测样本中的所有RNA转录本，以发现新型RNA，或开展基因表达分析。不过，测序的对象往往是组织样本或细胞群，这使得细...

  • 单细胞RNA测序的实验设计参考

    本文基于两种主流的单细胞RNA测序技术：Smart-seq2和10X Genomics 3’ sequencing，讨论了单细胞转录组测序的实验设计原则和注意事项，并对两种方法的优缺点进行比较分析。 02两种方法...

  • 单细胞RNA测序

    单细胞RNA测序文献解读、数据分析，主要针对10x Genomics数据 摘要：不同的测序平台或同一平台不同样本得到的测序数据需要去除批次效应后进行整合分析，拟采用Seurat2程序包对CelSeq，C...

  • 单细胞RNA测序

    单细胞RNA测序文献解读、数据分析，主要针对10x Genomics数据摘要：对Nature Methods上发表的文章Single-cell landscape of bronchoalveolar immune ...

  • 单细胞全转录组测序

    单细胞全转录组测序技术是在单细胞水平对全转录组进行扩增与测序的一项新技术。哈佛大学谢晓亮院士发明MALBAC（Multiple Annealing and Looping Based Amplification Cycles，简称MALBAC），即...

  • 单细胞RNA测序技术回顾（一）：Smart

    自2009年汤富酬等人首次报道单细胞RNA测序技术以来，许多新颖的技术被开发出来，可以更快速、更低成本地提供更多信息。这将大大增加我们对细胞的了解。在此，我们将回顾一些重要的单细胞RNA测序技术。 传统的基因表达研究，从芯片到...

  • 单细胞RNA测序技术回顾（三）：Drop

    在各种单细胞RNA测序技术被陆续开发出以后，相信大家的选择困难综合征又犯了，不知道该如何选择。好在，德国慕尼黑大学的研究人员比较了几种常用的几种方法，包括Smart-Seq、CEL-Seq、SCRB-seq以及Drop-seq。他们生成并分析了...

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