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  • 单细胞时空转录组

    虽然单细胞转录组测序记录的是细胞在某一个瞬时的状态，但是我们可以基于大量单细胞转录组数据的轨迹推断出细胞的动态变化过程，包括分化、成熟、对刺激的反应和细胞周期。目前，主要有两种细胞轨迹分析的方法：拟时序分析（pseudotime...

  • Nat Methods | 空间转录组与单细胞转录组整合分析工具大比拼

    来自中国科学技术大学的研究团队利用45个配对数据以及32个模拟数据评估了16种单细胞转录组与空间转录组的整合工具，发现Tangram、gimVI、SpaGE在预测RNA的空间分布上更有优势，而Cell2location...

  • 单细胞转录组制备分析系统

    智慧管理信息化软件系统对接LIMS信息化系统，打通数据孤岛，做到数据溯源高通量模块化设计。样本制备系统具有多种功能模块可选...

  • 单细胞转录组测序（scRNA

    高通量组学研究已经发展了快20年，从最开始的基因芯片到二代测序，从编码基因到lncRNA，circRNA，从三代测序的出现到单细胞组学研究的火热，相信在这个领域中共事的小伙伴们都深有感触。大家都知道高通量单细胞测序现在很火，但是不是所有的研究都适用，是不是所有的样本都能进行单细胞测序呢？本期小编带来

  • 多个单细胞转录组样本的数据整合之CCA

    文章预览 单细胞水平的研究是仅次于NGS的一次生物信息学领域的革命，同样的随随便便发CNS的黄金时期也过去了，现在想发高分文章，拿 多个病人的多个样本 进行单细胞转录组测序是非常正常的，比如下面的： 发表在 Nat Med. 2...

  • 面向非标准化单细胞转录组测序数据的聚类方法及系统

    本公开提供了一种面向非标准化单细胞转录组测序数据的聚类方法及系统，获取单细胞转录组测序数据；对获取的测序数据进行预处理；对预处理后的测序数据进行降维和聚类处理，得到聚类结果；将聚类结果根据Spearman相关性由小到大或由大到...

  • 单细胞数据库推荐|SpatialDB：让空间转录组数据可视化

    2019年11月，来自中国科学院生物物理研究所高通量测序中心的研究人员发布第一个单细胞空间转录组数据库及数据在线可视化平台：SpatialDB，为研究组织的空间细胞结构提供了一个资源库，并可能...

  • 面向非标准化单细胞转录组测序数据的聚类方法及系统

    1.一种面向非标准化单细胞转录组测序数据的聚类方法，其特征在于：包括以下过程：获取单细胞转录组测序数据；对获取的测序数据进行预处理；对预处理后的...

  • 怎样使用Loupe Cell Browser查看10X单细胞转录组分析结果

    ...就是该软件的基本功能，相比网页的显示结果，该软件交互式更强，可以更加方便的探究数据。看完上述内容，你们掌握怎样使用Loupe C...

  • 生命学院杨雪瑞课题组开发深度学习工具DeepLinc，使用单细胞空间转录组数据构建细胞互作网络

    作为近年来技术发展的前沿，单细胞空间组学技术同时提供了生理组织中细胞的空间定位及细胞内基因组、转录组、蛋白组等定量组学数据。细胞空间定位信息与分子特征谱的耦合为解析组织中细胞组装与...

单细胞转录组数据

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