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空间组学
实现3D、全景式、单细胞分辨率的多组学图谱的构建和应用，一直是生命科学和临床医学的研究方向之一。空间组学利用DNA纳米球影印技术，即利用测序后的DNA纳米球芯片对组织内的核酸进行捕获和测序，可以获得生物分子的序列和空间信息，构建生命的谷歌地图。空间组学是华大依托自主开发的DNBSEQ测序技术拓展形成的3D测序技术，可以将组织、细胞等样本中的mRNA进行空间条形码标记，通过测序获得mRNA的空间位置信息并进行还原，最终实现500nm分辨率
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PCF空间单细胞蛋白组（原Codex）技术如何运行？其原理是什么？
...全面的功能和应用。PCF的工作原理可以分为以下几个步骤：样品制备 ：首先，选择感兴趣的生物组织样本，如活体组织切片或固定、透明化的组织块。通过免疫荧光染色或其他标记方法，将特定的...
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空间转录组学在癌症研究中的应用和机遇
在空间转录组学数据分析中，紧迫的分析需求包括去除批次效应，进行细胞分割和反卷积注释（依赖高质量单细胞转录组数据集），识别空间区域和差异基因，探索细胞间相互作用，进行多维数据的综合分析（空间转录组数据加上单细胞转录组数据...
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医学院柯荣秦教授应邀参加首届TICSSO国际单细胞及空间组学大会并作主题报告
...团队研究的IISS技术可为scRNA-seq数据提供空间信息，基于该技术，可实现细胞空间图谱构建、空间单细胞分析及空间轨迹和细胞间互作等分析。另外，团队还开发了smCISH和vsmCISH等多...
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科学家研究实现单细胞转录组的空间映射
通过共嵌入和度量学习方法实现单细胞的空间映射。研究人员使用模拟和原位杂交数据对细胞跋涉进行了基准测试，证明了其准确性和稳定性。然后他们将细胞跋涉应用于现有的小鼠大脑和肾脏数据集，发现细胞跋涉可以检测到不同细胞类型和细胞状态。研究人员进一步对两个乳腺导管原位癌组织进行了单细胞RNA测序和空间转录组学实验，并将这些数据应用于细胞跋涉，结果表明细胞跋涉可以识别不同导管的肿瘤亚克隆细胞类型，以及邻近肿瘤区域的特定T细胞状态。综上所述，细胞跋涉可
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药学院范骁辉教授课题组在Nature Communications报道首个可将传统转录组测序数据重构至单细胞空间分辨率的方法
然而，目前的单细胞测序及空间转录组技术不仅耗时费力，而且成本极为昂贵，严重限制了其推广应用。与此同时，传统混样测序（ Bulk RNA-seq ）一直是生物医药研究的主流工具，特别是 TCGA...
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科研盘点 | 空间转录组学技术全面综述
...到超高分辨率的单细胞层次，对于癌症、免疫、神经、发育等领域，有着令人期待的应用前景。不同层面转录组研究一、空间转录组学技术...
单细胞和空间组学应用
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